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Las diatomeas son un grupo amplio y se pueden encontrar en los océanos, en agua dulce, en la tierra y en las superficies húmedas. La mayoría viven en aguas abiertas, aunque algunos viven en las capas superficiales de la interfase agua-sedimento, o incluso en condiciones atmosféricas húmedas. Son especialmente importantes en los océanos, donde se estima que contribuyen hasta un 45% de la base de la cadena alimentaria oceánica.